Ученые ИФХЭ РАН раскрыли механизм сборки вируса ВИЧ

Исследовательская группа под руководством Олега Батищева применила метод малоуглового рентгеновского рассеяния, чтобы изучить поведение белка Gag в условиях, приближенных к клеточной цитоплазме. Трудность заключалась в том, что белок обладает гибкой структурой и не поддается кристаллизации, что делает традиционную рентгеновскую дифракцию неэффективной. Для обработки полученных на синхротроне данных ученые использовали сложные вычислительные модели, сравнивая экспериментальные кривые рассеяния с теоретическими расчетами.

Эксперименты показали, что при высоких концентрациях молекулы Gag образуют только тримеры. Более крупные структуры, необходимые для формирования оболочки вируса, в чистом растворе не возникают. Это открытие доказывает, что для полноценной сборки вирусного каркаса белкам необходима внешняя опора — например, молекула РНК или поверхность клеточной мембраны. Ученые также установили форму тримера: две цепи формируют плотное ядро, а третья остается гибкой, вероятно, выступая «якорем» для захвата нуклеиновых кислот.

Поскольку работа велась с изолированными белками, не содержащими генетического материала, она не требует условий повышенной биологической безопасности. Это позволяет проводить глубокий физико-химический анализ молекул, недоступный многим вирусологическим лабораториям. Полученные данные станут фундаментом для поиска соединений, способных прерывать процесс самосборки вируса, что в перспективе поможет создать новые эффективные противовирусные препараты.